Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5C6

Gm10277, Predicted gene 10277, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10277Q6R5C6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10277Q6R5C6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms