Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms