Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dtx4Q6PDK8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms