Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb40Q6PCS8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms