Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gapvd1Q6PAR5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms