Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nwd2Q6P5U7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nwd2Q6P5U7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms