Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd2Q6NXI6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd2Q6NXI6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms