Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fndc3bQ6NWW9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fndc3bQ6NWW9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms