Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HelbQ6NVF4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms