Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo41Q6NS60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo41Q6NS60 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms