Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcd11Q6NS46 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd11Q6NS46 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms