Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sohlh1Q6IUP1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms