Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CltbQ6IRU5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms