Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw2Q6I6G8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hecw2Q6I6G8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms