Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms