Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk13Q69ZA1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms