Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms