Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms