Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fnip1Q68FD7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms