Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp9cQ66X01 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms