Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC080695Q66JY9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms