Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpgs2Q66JT5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms