Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2bQ64511 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top2bQ64511 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms