Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PtprdQ64487 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PtprdQ64487 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprdQ64487 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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