Protein–RNA interactions for Protein: Q64442

Sord, Sorbitol dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SordQ64442 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SordQ64442 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SordQ64442 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SordQ64442 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SordQ64442 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms