Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vat1Q62465 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms