Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm20854Q62461 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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