Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt6hQ62383 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms