Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SypQ62277 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SypQ62277 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SypQ62277 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SypQ62277 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SypQ62277 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SypQ62277 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms