Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms