Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5dQ62240 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm5dQ62240 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms