Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RhocQ62159 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhocQ62159 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhocQ62159 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms