Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sin3bQ62141 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3bQ62141 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms