Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprrQ62132 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms