Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd1Q62101 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd1Q62101 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd1Q62101 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkd1Q62101 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms