Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf9Q61179 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms