Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scarb1Q61009 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scarb1Q61009 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scarb1Q61009 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scarb1Q61009 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scarb1Q61009 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb1Q61009 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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