Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxg1Q60987 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxg1Q60987 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms