Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms