Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod1Q60867 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod1Q60867 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod1Q60867 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Neurod1Q60867 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Neurod1Q60867 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Neurod1Q60867 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms