Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms