Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Irgm1Q60766 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms