Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mkrn3Q60764 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms