Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha1Q60750 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms