Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samhd1Q60710 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms