Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmelQ60696 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms