Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms