Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Akap4Q60662 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Akap4Q60662 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Akap4Q60662 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Akap4Q60662 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Akap4Q60662 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Akap4Q60662 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Akap4Q60662 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Akap4Q60662 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms