Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2f1Q60632 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms