Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms